Re：113系

詳しくは知りませんが、リニューアル工事の際にブレーキ関係をいじった関係でそうなっている、とか。

調べたところ、鉄道ファン誌1999年6月号（p81）に113系S編成登場時の記事があり、改造メニューに「ブレーキ装置の改良（A弁のM非常弁化）」との記述がありました。
自分はあまり詳しくないのですが、A制御弁の場合、常用ブレーキでも自動ブレーキが使用できますが、M非常弁に交換されると非常ブレーキでしか自動ブレーキが使用できないようです。この改造により、自動ブレーキのみのEF64形と常用ブレーキを協調することができなくなったのでしょう。