1998年10月
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1998年10月、209系950番台ミツ24編成が三鷹電車区へ新製投入。
1999年11月29日にミツ24編成がミツ23編成へ変更。

2000年06月
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2000年6月13日に209系950番台ミツ23編成がE231系に編入されたため、209系は三鷹電車区から一旦消滅。

2003年12月
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2003年12月、習志野電車区から209系500番台が転入（転入元）。
209系900番台淘汰のため、E231系新製投入により、ミツ513～515編成が浦和電車区へ転出。
山手線6ドア車廃止に関連してE231系を捻出するため、京浜東北線E233系投入により、ウラ80編成が転入。
（2012年にCで始まる編成番号シールが各所へ貼り付け。サイトでの呼称をミツCXX編成に変更。）

2017年10月
（現行）

E231系500番台転入により、転属が進行。詳細はこちら。
2019年3月に全編成が運用離脱。

	千葉 三鷹 三鷹車両センター所属中央総武緩行線用209系500番台 縮小 詳細
	1号車	2号車	3号車	4号車	5号車	6号車	7号車	8号車	9号車	10号車
			◇					◇
編成	クハ209 500A ロング	サハ209 500A ロング	モハ209 500A ロング VVVF SC41C 菱 GTO	モハ208 500A ロング SIV SC37A 洋 GTO CP	サハ209 500A ロング	サハ209 500A ロング	サハ209 500A ロング	モハ209 500A ロング VVVF SC41C 菱 GTO	モハ208 500A ロング SIV SC37A 洋 GTO CP	クハ208 500A ロング	機器更新出場	動き(*1)
C501	501	501	501	501	502	503	504	502	502	501	（更新前離脱）	詳細
C502	502	505	503	503	506	507	508	504	504	502	（更新前離脱）	詳細
C503	503	509	505	505	510	511	512	506	506	503	（更新前離脱）	詳細
C504	504	513	507	507	514	515	516	508	508	504	（更新前離脱）	詳細
C505	505	517	509	509	518	519	520	510	510	505	（更新前離脱）	詳細
C506	506	521	511	511	522	523	524	512	512	506	（更新前離脱）	詳細
C507	507	525	513	513	526	527	528	514	514	507	（更新前離脱）	詳細
C508	508	529	515	515	530	531	532	516	516	508	（更新前離脱）	詳細
C509	509	533	517	517	534	535	536	518	518	509	（更新前離脱）	詳細
	千葉 三鷹 三鷹車両センター所属中央総武緩行線用209系500番台 縮小 詳細
	1号車	2号車	3号車	4号車	5号車	6号車	7号車	8号車	9号車	10号車
			＜					＜
編成	クハ209 500A ロング	サハ209 500A ロング	モハ209 500B ロング VVVF SC41C 菱 GTO	モハ208 500A ロング SIV SC37A 洋 GTO CP	サハ209 500A ロング	サハ209 500A ロング	サハ209 500A ロング	モハ209 500B ロング VVVF SC41C 菱 GTO	モハ208 500A ロング SIV SC37A 洋 GTO CP	クハ208 500A ロング	機器更新出場	動き(*1)
C510	510	537	519	519	538	539	540	520	520	510	（更新前離脱）	詳細
C511	511	541	521	521	542	543	544	522	522	511	（更新前離脱）	詳細
C512	512	545	523	523	546	547	548	524	524	512	（更新前離脱）	詳細
C516	516	561	531	531	562	563	564	532	532	516	（更新前離脱）	詳細

凡例

(*1) - 他線への転用が進行中。詳細はこちら。