いちさと

数十年に一度の水害を考慮し、2mの盛り土がされていたようですが、想定を超えてしまったようですね。
https://www.pacific.co.jp/service/project/hokuriku-shinkansen/

建設主体でかつ、水没した地上設備を保有するJRTTも、今回の被害で建設時の基準を改めるかもしれません。

なお、長野新幹線車両センターでは、現在も社員36名が孤立しているようです。

長野県によると、長野市の北陸新幹線車両センターで36人が孤立しており、自衛隊が救助を計画しています。

— 信毎web (@shinmaiweb) October 13, 2019

おっしゃる通り、性能試験は必要な試験項目を満足する試験区間を選ぶので、全営業区間を走行する必要はありません。しかし、高架化する区間を走らないように設定できるかどうかは別問題なんですよ。
例えば、PQ測定なら、曲線半径、カント不足量、カント逓減倍率などから、必要な曲線が決まってきます。必要な試験区間が高架化区間の先だけに存在するのであれば、高架化区間へを通って試験区間へ赴かないといけません。試験項目が前後すると、測定器の仮設を一からやり直すことになります。

そして何より、そのような仮定をしてまで、高架化前に入線しないと推測する理由は何なのでしょうか。そこが分かりません。

@2250ega
千ケヨ鉄さんがほぼ同時に投稿されましたが、W7系2編成も被災しています。
今回の状況だと、近年の軽量化よりも、浸水直後の浮力（∝浸水体積）のほうが2桁くらい大きく、支配的だと思います。

まず今回の台風で被災された方々にお見舞い申し上げます。
NHKによると、今回、長野新幹線車両センターで水没したのはE7系8編成、W7系2編成です。人命に影響が出なかったようで何よりです。
https://www3.nhk.or.jp/shutoken-news/20191013/1000038250.html

また、少なくとも2編成で大半の車両が脱線しています。朝よりも昼のほうが水深が深くなっているようです。
https://www.sankei.com/photo/story/news/191013/sty1910130005-n1.html

E7系は今年度から来年度にかけて、計8編成の新製予定があることが不幸中の幸いですが、短期的には車両不足が避けられません。また、機械設備の復旧まで…[ 続きを読む ]

高架化工事は多くの場合、試運転1本で全形式ぶっつけ本番なわけで、わざわざ80000形の性能試験日程をずらすとは考えにくい気がしますね。

追加ですが、出場後に方転回送が東金線経由で行われたようです。

2019年10月11日
【方向転換回送】
回9649M：209系マリC612編成

先日の踏切事故の後、編成が逆向きのまま大宮総合車両センターへ入場していたため、出場後そのまま成東経由で方向転換を行いました。 pic.twitter.com/FWpPwFq43n

— うさねこ (@Usaneko_231) October 11, 2019

前例となるハエ71編成は広告などを残したままで、一度は戻ってくる可能性が高そうですので、当該の回送がハエ72編成だとしても、最終的な運用離脱なのかが微妙なところです。もう数か月走るなら防犯カメラくらい付けてしまいそうに感じます。
ご承知の通り、オリンピック対応で運用数が変わるなど、可能性の低い不確定要素が色々ありますが、さちさんの仮定の中で、一番弱そうに感じたのは上記の点です。

ご自身で確認されたのであれば、わざわざ他者のTwitterを紹介しなくても大丈夫です。NA-06編成は編成番号が貼られていたということでしょうか。

どういうことか分かりませんでした。前例からすると、まだ武田菱なら出場は先かと思います。武田菱のまま出場しそうな状況（もう京急脇に居たとか）ということでしょうか。

SC59とSC59Aは（前例は見当たりませんが）取付け互換性があるかもしれませんね。
休車のついでにPUを外したのか、PUが原因で休車になったのかすら分からない現状ですが…。